在如今全球化竞争日益激烈的商业环境下，企业需要通过注册商标和软著来保护自己的知识产权。商标是产品和服务的标志，而软著是对软件源代码的保护，包括其设计和实现。申请软著可以保护企业的软件源代码不被侵犯，防止他人抄袭、仿制和盗版，而商标则可以帮助企业建立品牌形象、树立企业形象、促进品牌定位。

在软著申请方面，企业需要准备详细的软件说明书、软件版权协议、软件源代码、软件使用说明书和软件的安装包等相关资料，并在相应的知识产权管理部门完成软著申请的整个流程。这些流程包括软著申请的流程、软著审查、软著授权及动态管理等。另外，申请人还应该注意申请软著的地域特征和目前的政策法规规定，以便更顺利地完成软著申请。

软著保护不仅仅是申请，它还需要企业拥有一定的软著保护策略。保护策略包括维护软著的完整性和版权有效性、加强维权保护力度、确保使用软件的安全性和法律合规性等。企业可以通过专业的知识产权代理机构来帮助管理软著和商标，确保同行业竞争者不进行侵权行为，并及时采取法律措施维护自身的合法权益。

在实际工作中，还存在一些常见软著问题。例如：软著被侵权，如何申请著作权保护；如何解决软著授权后继续进行软件开发的问题；案件的庭前、庭审策略等。这类问题需要主动咨询专业的知识产权代理机构，获得专业的意见和建议。

申请软著和商标是企业合法权益的重要保护措施。应该根据企业自身需求和特点来制定软著和商标的保护策略，以保证知识产权的有效保护和维护。同时，建议企业遵循所在国家的法规和规定，与知识产权代理机构积极合作，为企业的发展提供合法保护。