你是一位网站开发者，开发了一款非常有用的网页脚本代码并打算申请软件著作权。但是在申请过程中你发现，自己的代码有些混乱，不知道怎样才能将其整理得更加规范清晰。对于这一问题，我们为你提供以下整理网页脚本代码的方法。

你需要注意代码结构，将代码按照自己的理解进行适当的分块，看看哪些部分是可复用的，而哪些是需要独立添加的，这样有助于代码的重复利用，减少代码量。

对于注释这一部分，你需要全面了解代码中添加注释的重要性。注释可以使得代码的可读性增加，同时方便日后的调试和维护。注释的内容应当详尽而且准确，避免使用过于简短的注释内容，但也不要过度描述。

总体而言，在整理网页脚本代码时，需要注意以下几点：

1. 代码块的分割和结构化整理；

2. 代码注释的添加；

3. 函数或变量名的考虑；

4. 确认代码符合国家版权登记局的软件著作权登记规定。

关于软著申请，我们还需要额外强调几点：

1. 软著申请材料需要包括代码源文件、相关文档、和版权登记申请表等，提交时需要准确无误；

2. 第三方已拥有版权的代码不得在自己的软著申请材料中使用；

3. 软著申请审核需要时间，一般在3-6个月不等，申请人需要耐心等待和配合版权局的审核工作；

4. 成功获得软著登记并不等同于完全保护版权，准备好在开源社区和非授权使用等情况下，应对版权侵权可能带来的问题。

因此，在申请软著的过程中需要保持谨慎和专业的态度，对于整理代码也不可掉以轻心。清晰的代码可以减轻你在代码的修改和维护过程中遇到的困难和问题，轻松整理网页脚本代码，就能更轻松地完成软著申请和获得版权保护！