计算机软著是指对计算机软件作品进行保护的一种措施。市场监督管理局是负责计算机软著登记的机构，而软著的保护也是一个十分重要的问题。

申请软著，须符合软件保护法等相关法律法规的规定。申请人首先需要提交软著登记申请，并在申请中提交软件源代码、说明书等材料。一般来说，申请流程大概需要三个月左右的时间，而加急通常可以在一个月内完成。

为了保护软著的版权，需要采取一些相应的策略。要加强内部管理，保障软著的保密性。在开发过程中尽量注重创新，而不是追求简单的商业模仿。另外，要保证开发团队的授权合法性，不得侵犯他人知识产权。保持警惕，随时监测他人可能侵权的行为。

在实际运用中，软著保护也面临着一些常见问题。例如，软著的作品来源是否可以复制？如何证明自己是软著的版权人？如何制定软著的许可协议等等。对于这些问题，一些解决方案可能包括：尊重他人的权利、维护自己的权益、制定合法的许可协议等等。

通过加强相关的知识产权保护，可以创造更好的软件市场环境。同时，政府和企业应该合作，加强知识产权的监督和管理，维护合法权益，打造公平竞争的市场环境。

市场监督管理局计算机软著保护是一个重要的法律保护措施。利用这种措施，可以保护创意和知识产权，同时促进社会进步。在实践中，需要注重维护软著的权益，加强创新和保密，制定合法的许可协议等等。