在当今信息化时代，软件行业的发展日新月异，软件著作权的申请和保护也变得越来越重要。软件著作权（软著）是指在计算机软件开发中，作者对其所创造的计算机软件享有的知识产权。

如何申请软著呢？需要准备软件著作权申请书、软件著作权表格、软件源代码及其他相关资料。填写软件著作权申请书，并将其提交至国家版权局软件著作权登记中心或者各省、市版权局软件著作权登记中心进行登记，登记完成后，申请人将获得软件著作权证书，证明其对该软件的版权。

除了申请软著，如何保护软著也是软件公司重要的问题。一方面，开发软件时需要关注版权问题，避免侵犯他人版权；另一方面，对软著进行登记保护，在发现侵权行为时，可以通过法律途径来维护自身利益。同时，在商业合作中，也需要注意保护自身的软著权利，签订合同时应注明所有权、使用范围等细节条款。

常见的一些软著问题也需要注意解决。例如，“软著与专利有什么不同？”，“软著登记的费用是多少？”，“如果软著登记不通过该怎么办？”，等等。针对这些问题，需要在相应的查证和咨询后，及时采取对应措施。

软件著作权的保护是软件公司的重要议题。要想获得软著权，则需要注意申请流程，避免侵权行为；同时，要注重维护自身权益，注重商业保护措施，若有问题需要及时解决。通过加强软著权益保护，国内的软件行业才能走得更加稳健。